Chương trình đào tạo Cao đẳng Dược tại Trường Cao đẳng Y Dược Pasteur được thực hiện theo một chương trình chuẩn, nhằm đào tạo được những nguồn nhân lực chất lượng. Chương trình đào tạo Cao đẳng Dược năm 2020 đạt chuẩn Theo đó, trong thời gian đào tạo 3 năm sinh viên ngành Dược tại Trường Cao đẳng Dược Pasteur sẽ được học những môn cơ sở bao gồm: Chủ nghĩa Mác - Lên Nin; Tư tưởng đạo đức Hồ Chí Minh; Đường lối cách mạng Việt Nam; Chính trị; Kinh tế; Sinh học đại cương; Hóa hữu cơ;….; Sinh viên Cao đẳng Điều dưỡng TPHCM Tổng hợp những môn học cơ sở khi theo học ngành Cao đẳng Dược bao gồm: Môn giải phẫu; Môn ký sinh trùng; Vi sinh; Sinh lý; Môn hóa sinh; Bệnh học; Sinh học di truyền; Sinh lý miễn dịch; Những bộ môn về chuyên ngành sẽ liên quan trực tiếp đến những môn liên quan đến bào chế thuốc, kiểm tra, quản lý và kiểm duyệt thuốc, nghiên cứu thuốc như: Nghiên cứu và phát triển thuốc mới, bào chế và sinh dược học, ứng dụng công nghệ Nano trong bào chế thuốc, hóa phân tích, pháp chế dược, Marketing dược phẩm, Dược xã hội học, bảo quản thuốc, kiểm nghiệm, quản lý kinh tế dược, dược cổ truyền, thông tin và cảnh giác dược, mỹ phẩm và thực phẩm chức năng, thực vật, dược lâm sàng, dược lý, dược liệu, hóa dược, đảm bảo chất lượng thuốc, rèn luyện thêm về kỹ năng giao tiếp,... Đây chính là các môn chuyên ngành cơ bả nhất của ngành Dược mà sinh viên khi học tại Cao đẳng Y dược TPHCM - Trường Cao đẳng Y Dược Pateur sẽ được đào tạo bài bản. Ở kỳ cuối sinh viên được nâng cao đào tạo chuyên sâu vào thực hành, kết hợp với đi thực tập lâm sàng tại các bệnh viện, nhà thuốc lớn do nhà trường giới thiệu. Vì vậy, sinh viên sau khi tốt nghiệp ra trường tự tin hơn trong công việc. Tuy nhiên, đối với hệ Liên thông và Văn bằng 2 Cao đẳng Dược sẽ có chương trình đào tạo khác so với hệ Cao đẳng Dược hệ chính quy.